BOB半岛·综合体育(中国)官方网站

真核转录组

  • 产品简介
  • 技术流程
  • 样本要求
  • FAQ


转录组测序可以通过高通量测序平台针对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA进行测序,快速检测基因表达量、序列结构及功能注释信息,了解不同表型下基因表达的差异转态。目前已经广泛应用于动植物发育调控、胁迫研究、遗传进化、发病机制研究等方向。


产品优势
  • 经验丰富
    提取成功率91%+,建库成功率99%+;物种经验100+,项目经验10000+
  • 快速周期
    自动化操作体系,保证数据结果的同时,实现快速交付
  • 组学分析
    支持以转录组为核心,联合表观,基因组、单细胞产品等多种分析策略
  • 一站式服务
    售前方案设计,售中异常解决,售后个性化分析,多方位服务
产品特点
  • 应用广泛
    物种不限,有参无参均可分析,覆盖生物学,农学,医学领域
  • 短平快
    技术成熟、周期快速、质量可靠
  • 组学桥梁
    是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带,可以与上下游多种组学联合分析
  • 分析丰富
    除基因表达及结构分析外,对于检测低丰度转录本和发现新转录本具有其独特的优势
企业微信截图_17301773476964.png
产品类型测序平台及策略推荐数据量周期
真核转录组测序

Illumina X Plus PE150

DNBSEQ-T7 PE150

有参:6/8/10 G clean data14天
无参:6/8/10 G clean data24天

产品类型样品要求
真核转录组样品需求量

≥0.5μg

样品浓度

≥30 ng/μl

样品纯度
OD260/280=1.8~2.2;OD260/230 除特别异常(负值 、超 2.5),不纳入判定
RNA完整性

RIN≥4

           
  • Q: 做转录组测序一般需要测多大数据量?
    A:
    转录组测序所需的测序量随研究目的的不同而有所差异。目前,为保证数据分析结果的可靠性和准确性,安诺基因推荐对有参考基因组的转录组采用最低6 Gb clean data进行后续分析,如果想检测到低丰度的转录本推荐采用10 Gb clean data。如果没有参考基因组,需要进行转录本的拼接组装,为了拼接组装的完整性,安诺基因推荐最低10 Gb clean data的转录组测序。

  • Q: 转录组测序的技术重复性很高,那是否还有必要设生物学重复?
    A:
    目前我们推荐至少设置3个及以上生物学重复,5个以上的生物学重复更好。2011年7月Hansen发表的文章表明生物学差异是基因自身表达的特性,与检测技术的选择以及数据处理的方式无关。在样本分析过程中,常会出现某个样本离群导致生物学重复不足3个的情况,为了避免后期投稿过程中受到审稿人的质疑,我们建议尽可能的多设置生物学重复,增加差异基因的检出率,减小整体假阳性率。

  • Q: 无参转录组拼接注释后,能得到的注释基因有多少?
    A:
    注释基因的多少跟所研究的物种直接相关,如某些比较重要的物种基因研究的比较多,功能也比较清楚,注释得到的基因就会很多,反之则会比较少。
XML 地图