DNBSEQ T7 测序服务
建库测序10天,纯测序包lane3天,纯测序散样7天
外来文库类型 | 片段范围 | 峰形 | 单个环化投入文库总量 | 浓度 | 体积 |
illumina 文库(dsDNA,需要进行文库转化) | 200 ~ 600 bp,同时主带集中在±100 bp 以内 | 峰形单一,无杂峰和二聚体 | ≥100ng | ≥2.3ng/μl | ≥10μl |
MGI文库(dsDNA) | 200 ~ 600 bp,同时主带集中在±100 bp 以内 | 峰形单一,无杂峰和二聚体 | ≥300ng | ≥3ng/μl | ≥10μl |
注:
(1)送MGI文库不建议送环化产物,直接送构建好的双链线性DNA文库(即环化前产物),如客户已构建完成环化产物,需要提供双链线性DNA的文库质检峰图,以供安诺实验评估文库质量。
(2)环化产物送样要求:总量不少于40ng,且单个环化产物pooling内部index不重复。
(3)包芯片文库总量:illumina结构文库至少提供100ng文库,MGI结构文库至少提供660ng文库。
(4)每张芯片上机体积需求:一张测序载片在PE150测序模式(V2.0版试剂)下需要加载DNB体积为300ul,每个DNB制备体积为90μl,因此每张载片至少需要制备4个DNB。
(5)文库为线性dsDNA文库,可以根据如下公式对dsDNA pmol与ng之间进行转换 1pmol dsDNA对应的质量(ng)=((DNA主片段大小(bp))/1000bp)×660ng。
DNBSEQ-T7运行周期短,测序单价低,日产能达6TB。基于DNBSEQTM技术,已广泛适用于全基因组测序、超深度外显子组测序、表观基因组测序、转录组测序和单细胞测序等大型测序项目。
1、数据量
以下统计了DNBSEQ-T7平台2022年1-10月份662张 Flowcell的数据产出,平均每张Flowcell产出为1603.75 G。碱基准确度、测序均一性、数据有效比例等指标均表现优质。
DNBSEQ T7 PE150测序数据统计
月份 | 1 月 | 2 月 | 3 月 | 4 月 | 5 月 | 6 月 | 7 月 | 8 月 | 9 月 | 10月 |
数据产出/G | 1638 | 1623 | 1621 | 1587 | 1607 | 1597 | 1581 | 1590 | 1592 | 1601 |
质量值Q30 | 91.3 | 91.2 | 91 | 91.5 | 90.7 | 91.6 | 92.7 | 94.5 | 93.1 | 93.9 |
1、碱基质量分布图
碱基测序质量反映了测序错误率,质量值越大,错误率越小。
2、碱基含量分布图
碱基含量分布图用于检测有无AT、GC分离现象,而这种现象可能是测序或者建库所带来的,它会影响后续的定量分析。理论上每个测序循环上的GC及AT含量应分别相等,且在整个测序过程基本稳定不变,呈水平线,而N含量也反映了测序质量的好坏。
类别 | 官方指标 | 安诺基因产出 |
每次运行最大的芯片数 | 4 | |
每次运行FC的数量 | 4(1张芯片有1条lane) | |
每次运行的通量 | 5.2 Tb | ≥5.5 Tb |
支持的读长 | 2*150 bp | |
运行时间 | ~24h | |
碱基质量 | Q30≥80% | Q30≥85% |