NextSeq 550AR(国械注准20173220330)测序服务
建库测序12天,纯测序包FC 5天
送样标准
文库类型 | 片段大小质量标准 | 体积(μl) | QPCR 浓度(nM/L) | 质量浓度 (ng/μl) Qubit 检测 | 体积(μl) |
平均插入片段100 bp 文库 | 1. 引物二聚体浓度<3% 2. 客户提供片段大小偏差<10% 3. 插入片段小于600bp | >10 | >7 | >1.0 | 1.5mL离心管 |
平均插入片段200 bp 文库 | >10 | >10 | >1.8 | ||
平均插入片段300 bp 文库 | >10 | >10 | >2.5 | ||
平均插入片段400 bp 文库 | >10 | >10 | >3.2 | ||
平均插入片段500 bp 文库 | >10 | >10 | >4.0 |
注:
Qubit 检测浓度要求与文库插入片段直接相关,上机定量以 QPCR 浓度为准;
若文库引物二聚体比例>5%或文库片段大小偏差>10%则需要项目管理与客户沟通,风险上机客户需承担相应风险;
NextSeq 550AR平台(国械注准20173220330)要求包FC测序。
平台参数
类别 | 数据量 | 数据质量 |
SE50 | 包FC(330-400 M raw reads) | Q30≥90% |
SE75 | 包FC(330-400 M raw reads) | Q30≥83% |
PE50 | 包FC(中通量130 M raw reads,高通量400 M raw reads) | Q30≥80% |
PE150 | 包FC(400 M raw reads) | Q30≥80% |