开年尝鲜|MAS Bulk Iso-seq技术「龍」重登场
发布时间:2024-01-17
三代测序技术在获取全长mRNA序列方面有着突出贡献,但在准确定量和发现新的RNA同源异构体方面仍然存在局限性。近期PacBio推出Kinnex全长RNA测序试剂盒,将MAS-seq技术扩展至Bulk RNA测序应用,我们称之为MAS Bulk Iso-seq技术。该技术可将 cDNA 串联成优质的单分子长片段,无需打断拼接,实现Revio平台对完整全长转录本的测序。
表1 二代和三代转录组测序内容对比
目前,PacBio官方了基于MAS-seq建库+Revio平台 HiFi测序技术的Bulk RNA测序数据。绘制饱和曲度线,展示在不同测序深度下基因和isoforms的检出数据(图1),发现在不同的测序深度下数据表现不同(表2),适当提升测序深度有助于增加低/中丰度转录本和复杂异构体的检出率,并在一定测序深度下实现转录本整体定量,不再需要依赖二代测序技术定量和测序纠错。
图1 HG002和UHRR样品的genes和isofroms饱和度曲线
为了助力更多学者的科学研究,BOB半岛·综合体育正式上线MAS Bulk Iso-seq技术,针对不同物种和不同科研需求,结合物种转录本复杂程度,我们为您推荐不同的测序数据量:动植物全基因组注释推荐5M reads,肿瘤疾病研究推荐10M reads,竭诚为您服务。
表2 部分样本Revio测序数据表现