精彩回顾|单细胞测序技术多维发展与应用论坛第四期
发布时间:2021-10-08
单细胞测序技术作为生命科学领域的革新技术,推动了神经科学、免疫、癌症等领域的发展和研究,已成为生命科学研究领域的焦点。经过十余年的发展,单细胞测序技术在通量、多组学、测序等方面都有了长足的发展。近几年来,空间维度的转录组测序技术获得了迅猛发展。本期专题让我们走进空间转录组,了解一下空转目前的应用进展。
论坛第四期,也是我们的收官之作,现已顺利结束。本期有幸邀请到山东大学的张晓鲁教授,10x Genomics的吴非博士,华中农业大学的史倩倩博士。下面是小编为大家带来的报告精彩回顾。
张晓鲁教授分享了空间组学技术及其应用实例。在众多空转技术中,10x Genomics Visium空转技术更为大家熟知。张老师分享了Visium技术的发展史,概括了Visium应用领域,通过两篇文章分享了Visium在发育与免疫方向的应用实例,同时分享了自己的课题思路,系统地为大家介绍了Visium空转技术的科研工具定位。
吴非博士带来了题为“结合单细胞和空间技术构建生物学新洞见”的报告。作为10x Genomics高级技术应用专家,吴博为大家系统全面的介绍了10x Genomics多组学产品,单细胞系列(scRNA-Seq,VDJ,表面蛋白,sn-ATAC,ATAC+GEX双组学)与空间转录组系列(FF与FFPE)。着重对ATAC+GEX双组学,scRNA-Seq+Visium应用进展进行了分享。
史倩倩博士分享了浅谈机器学习方法在单细胞聚类和空间聚类上的使用。目前空间转录组常与单细胞转录组技术一起应用,两者之间的数据关联方式,也是时下比较热门的研究方向。史老师重点分享了一些自己在单细胞和空间转录组关联方面的分析和算法。