BOB半岛·综合体育单细胞全长转录组测序基于10X Genomics和MAS串联技术，通过二代测序+三代测序联用方法，不仅可以获得更加精细的细胞聚类、细胞注释，而且还可以挖掘到在肿瘤、系统性疾病、发育生物学等研究中非要重要的可变剪切、融合基因、RNA水平突变等信息。
应用领域
- 肿瘤的发生发展研究
- 疾病潜在标志性基因的挖掘
- 胚胎、器官发育轨迹的研究
- 胁迫响应机制的探究等
单细胞全长转录组
- 产品简介
- 技术流程
- 样本要求
- FAQ
流程图源自Pacbio官网
| 样品要求 | |
| 细胞分离 | 由合作方或安诺完成单细胞悬浮液的制备 |
| 样品类型 | 活体新鲜完整细胞的细胞悬浮液；冻存的细胞悬浮液；不适于经固定、染色等处理的样本 |
| 样品总量 | 总量>6*105个，同一个细胞平行准备2份（1份质检，1份实验） |
| 样品浓度 | 700-1200个/μl |
| 样品质量 | 细胞不能成团，少碎片，活性>85%，细胞直径<30μm，不存在逆转录抑制剂及非细胞的核酸分子 |
| 细胞冻存液保存 | 分装保存于冻存液中，细胞冻存液：DMEM+20%FBS+10%DMSO |
| 冻存液细胞浓度 | 100万个细胞/ml，每1ml分装至1个冻存管 |
- Q：单细胞全长转录组实验流程A：前部分实验与10X Genomics单细胞转录组一致，通过微流控平台将带有条形码和引物的凝胶珠与单个细胞包裹在油滴中。在每个GEM中，凝胶珠溶解，细胞裂解释放mRNA，通过逆转录产生用于带Barcode和UMI信息的cDNA。然后将cDNA一分为二，同时进行二代建库测序和MAS串联三代建库测序。